Auferstehung wird der Prozess genannt, bei dem das Bewusstsein oder die Programmierung von einigen Zylonen, die zerstört wurden gerettet wird.
Auferstehung humanoider Zylonen
Wenn der Körper eines humanoiden Zylonen aufhört zu funktionieren, kann das Bewusstsein in eine identische Kopie des Körpers transferiert werden (Miniserie).
Damit eine Auferstehung geschehen kann, muss der sterbende Agent in Reichweite eines Auferstehungspunktes sein, oder das Bewusstsein eines humanoiden Zylonen läuft Gefahr, für immer verloren zu gehen. Wie die Transmission des Bewusstseins genau abläuft muss erst noch geklärt werden, aber eine Art von Funk ist wahrscheinlich. Bekannte Auferstehungspunkte sind die Heimatwelt der Zylonen und das Auferstehungsschiff. Möglicherweise gibt es auch solche Einrichtungen auf Planeten wo sich zahlreiche Agenten treffen. Eine Auferstehungseinrichtung hat es wahrscheinlich auch auf dem besetzten Caprica gegeben. Am Auferstehungspunkt gibt es mindestens einen Auferstehungstank, in dem ein duplizierter Körper in einer undurchsichtigen, dickflüssigen Substanz eingebettet ist, um auf den Transfer zu warten (Download).
Während humanoide Zylonen anscheinend unbegrenzt widerauferstehen können, können dennoch zwei Probleme auftreten. Wiederholte Auferstehungen können Schmerzen verursachen und andere unerklärliche Symptome hervorrufen. Ein Cavil berichtet von schweren Kopfschmerzen nach einer Auferstehung, und von einem Gefühl "als ob ein glühend heißes Stück Eisen in meinen Kopf eindringt" (Exodus, Teil I). Dies könnte eine subjektive Erfahrung oder ein Einzelfall sein, da Nummer Drei eine Auferstehung als verjüngend empfindet (Download).
Weit mehr bedrohlich ist es, wenn die Erinnerungen eines humanoiden Zylonen kompromittiert, beschädigt oder anderweitig verdorben sind (basierend auf der Perspektive der anderen Zylonen). Wenn das passiert, kann das Bewusstsein statt heruntergeladen, in der Box eingefrohren werden; eine drastische Maßnahme in der Gesellschaft der Zylonen, die mit unserer Todesstrafe gleichzusetzen ist. Gespräche in "Download" deutet darauf hin, dass dies entweder sehr selten oder noch nie aufgetreten ist abgesehen von dem einfrieren der Nummer Drei Serie in "Die Supernova".
Über den Mechanismus des Herunterladens ist nicht viel bekannt.
Auferstehung von Jägern
Die halb-empfindungsfähige Persönlichkeiten von Jäger können auch gerettet werden. Dies erlaubt es dem auferstandenen Jäger aus seinen Fehlern zu lernen und mit größeren taktischen Kenntnissen erneut weiter zu kämpfen (Der beste Jäger der Zylonen).
Der Jäger, bekannt als "Scar", könnte so ein erfahrener Jäger sein. Die Scar Persönlichkeit schoss viele Koloniale Vipern ab, bevor sie für immer zerstört wurde. Damit ein Jäger wieder auferstehen kann, muss auch ein Auferstehungsschiff in der Nähe sein.